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Windowsはフロッピーディスクドライブを物理的に接続していなくてもデフォルトでドライブ一覧に追加してしまう。
デバイスマネージャーからフロッピードライブを無効にして「コンピュータ」の中に表示されてない状態にしたら、Mayaのファイルダイアログが瞬時に開くようになった。

これに気づくまでOSネイティブの設定でやってた。無いドライブを参照しようとしていたから遅かったんだろうな。